工业脱水机恒温系统一般有两个作用：
(1)控制轴承温度，使轴承不致过热。
(2)冷却离心腔，以控制转头温度。
操作者预选温度，通过温度控制系统使离心腔温度下降，腔内红外线温度探测器反映转头实际温度。达到顶定温度时，控制换向阀使离心腔冷却或加热，使转头温度恒定在预定温度±1℃o
致冷剂一般有F12、F22．有些日本仪器用502致冷剂。
工业脱水机离心转头的温度测试可采用不同的方法如日立多用热电偶，精度一般达±1℃。美国BECKMAN、英国MSE多用红外线探测温度，精度比热电偶高。
冷却装置有的工业脱水机采用冷却水流过轴承，有的则用内循环冷却液，保持轴承温度不升高。
为了确保操作人员和工业脱水机的安全，避免离心时发生意外事故，工业脱水机厂家都为工业脱水机专门设计了防护系统。厂家不同，配备的工业脱水机防护系统也不尽相同。目前但是的工业脱水机防护系统大致来说主要有：门锁保护、转头识别以及转头平衡检测。
1．门锁防护：采用机械和电子双层门锁，门锁关闭后，工业脱水机才能启动，电机停转后，才能打开离心空盖。
2．转头识别：各厂家生产的转头的形状、规格、大小及技术参数都有差别，不能混用，否则容易引起转头在离心时炸裂，带来安全隐患。防护系统设置了转头识别装置，为每一个转头设置了唯一的编码，或在每一个转头的底部镶嵌一定数量的小磁铁，更复杂的有超声波和无线射频转头识别，在离心前对转头进行扫描，并将扫描信号与本机设定的转头比较，如发现转头有误，机器将自动提示。
